Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC9Q96Q05 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC9Q96Q05 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms