Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP4Q96PP9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms