Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC114Q96M63 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms