Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD8Q96LT4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms