Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EP400Q96L91 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EP400Q96L91 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms