Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHAMP1Q96JM3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms