Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 271.8 ms