Protein–RNA interactions for Protein: Q96IT1

ZNF496, Zinc finger protein 496, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF496Q96IT1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF496Q96IT1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF496Q96IT1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF496Q96IT1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF496Q96IT1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF496Q96IT1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF496Q96IT1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF496Q96IT1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF496Q96IT1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF496Q96IT1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF496Q96IT1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF496Q96IT1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF496Q96IT1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF496Q96IT1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF496Q96IT1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF496Q96IT1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF496Q96IT1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF496Q96IT1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF496Q96IT1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF496Q96IT1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF496Q96IT1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF496Q96IT1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF496Q96IT1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF496Q96IT1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF496Q96IT1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF496Q96IT1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF496Q96IT1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF496Q96IT1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF496Q96IT1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF496Q96IT1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF496Q96IT1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms