Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms