Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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