Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMIGD2Q96BF3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms