Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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