Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3AQ92664 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms