Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms