Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PNLDC1Q8NA58 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNLDC1Q8NA58 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms