Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHCHD4Q8N4Q1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
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