Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms