Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC47Q8N1G4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC47Q8N1G4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC47Q8N1G4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC47Q8N1G4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC47Q8N1G4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC47Q8N1G4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC47Q8N1G4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC47Q8N1G4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC47Q8N1G4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC47Q8N1G4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC47Q8N1G4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC47Q8N1G4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC47Q8N1G4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC47Q8N1G4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRRC47Q8N1G4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRRC47Q8N1G4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRRC47Q8N1G4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms