Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms