Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX29P2Q8IUI4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms