Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms