Protein–RNA interactions for Protein: Q86VZ5

SGMS1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1Q86VZ5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGMS1Q86VZ5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGMS1Q86VZ5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGMS1Q86VZ5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGMS1Q86VZ5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGMS1Q86VZ5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGMS1Q86VZ5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGMS1Q86VZ5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGMS1Q86VZ5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGMS1Q86VZ5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGMS1Q86VZ5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGMS1Q86VZ5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGMS1Q86VZ5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGMS1Q86VZ5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGMS1Q86VZ5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGMS1Q86VZ5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGMS1Q86VZ5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGMS1Q86VZ5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SGMS1Q86VZ5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGMS1Q86VZ5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGMS1Q86VZ5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGMS1Q86VZ5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGMS1Q86VZ5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGMS1Q86VZ5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGMS1Q86VZ5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGMS1Q86VZ5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SGMS1Q86VZ5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SGMS1Q86VZ5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SGMS1Q86VZ5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms