Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3K6

MIER3, Mesoderm induction early response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIER3Q7Z3K6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIER3Q7Z3K6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms