Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
BBS12Q6ZW61 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms