Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf139Q6ZV77 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf139Q6ZV77 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms