Protein–RNA interactions for Protein: Q6VMQ6

ATF7IP, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7IPQ6VMQ6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATF7IPQ6VMQ6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF7IPQ6VMQ6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF7IPQ6VMQ6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF7IPQ6VMQ6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF7IPQ6VMQ6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF7IPQ6VMQ6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF7IPQ6VMQ6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF7IPQ6VMQ6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF7IPQ6VMQ6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF7IPQ6VMQ6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF7IPQ6VMQ6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF7IPQ6VMQ6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF7IPQ6VMQ6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF7IPQ6VMQ6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF7IPQ6VMQ6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF7IPQ6VMQ6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF7IPQ6VMQ6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF7IPQ6VMQ6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF7IPQ6VMQ6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF7IPQ6VMQ6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF7IPQ6VMQ6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATF7IPQ6VMQ6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATF7IPQ6VMQ6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATF7IPQ6VMQ6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms