Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP12Q6UXS9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms