Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6P435 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6P435 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6P435 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6P435 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6P435 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6P435 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6P435 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6P435 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6P435 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6P435 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6P435 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6P435 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6P435 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6P435 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6P435 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6P435 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6P435 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6P435 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q6P435 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q6P435 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q6P435 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q6P435 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q6P435 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q6P435 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q6P435 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q6P435 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q6P435 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q6P435 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q6P435 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q6P435 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q6P435 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q6P435 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q6P435 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q6P435 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q6P435 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q6P435 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q6P435 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q6P435 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q6P435 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q6P435 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q6P435 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q6P435 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q6P435 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q6P435 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q6P435 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q6P435 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q6P435 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q6P435 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6P435 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6P435 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6P435 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6P435 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6P435 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6P435 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6P435 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6P435 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6P435 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6P435 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6P435 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6P435 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6P435 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6P435 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6P435 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6P435 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6P435 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6P435 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6P435 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6P435 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6P435 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6P435 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6P435 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6P435 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6P435 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6P435 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6P435 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6P435 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6P435 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6P435 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6P435 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6P435 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6P435 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6P435 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6P435 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6P435 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6P435 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6P435 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6P435 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6P435 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6P435 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6P435 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6P435 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6P435 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6P435 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6P435 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6P435 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6P435 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6P435 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6P435 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6P435 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms