Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CARMIL2Q6F5E8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms