Protein–RNA interactions for Protein: Q5ZPR3

CD276, CD276 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD276Q5ZPR3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD276Q5ZPR3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD276Q5ZPR3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD276Q5ZPR3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD276Q5ZPR3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD276Q5ZPR3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD276Q5ZPR3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CD276Q5ZPR3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD276Q5ZPR3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD276Q5ZPR3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD276Q5ZPR3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD276Q5ZPR3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD276Q5ZPR3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD276Q5ZPR3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms