Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF123Q5XPI4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF123Q5XPI4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms