Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms