Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ATAD3CQ5T2N8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATAD3CQ5T2N8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATAD3CQ5T2N8 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATAD3CQ5T2N8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATAD3CQ5T2N8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATAD3CQ5T2N8 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATAD3CQ5T2N8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATAD3CQ5T2N8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATAD3CQ5T2N8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATAD3CQ5T2N8 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATAD3CQ5T2N8 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATAD3CQ5T2N8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATAD3CQ5T2N8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ATAD3CQ5T2N8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATAD3CQ5T2N8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ATAD3CQ5T2N8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATAD3CQ5T2N8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ATAD3CQ5T2N8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATAD3CQ5T2N8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATAD3CQ5T2N8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ATAD3CQ5T2N8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ATAD3CQ5T2N8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ATAD3CQ5T2N8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ATAD3CQ5T2N8 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATAD3CQ5T2N8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATAD3CQ5T2N8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATAD3CQ5T2N8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATAD3CQ5T2N8 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATAD3CQ5T2N8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATAD3CQ5T2N8 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATAD3CQ5T2N8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATAD3CQ5T2N8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ATAD3CQ5T2N8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATAD3CQ5T2N8 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATAD3CQ5T2N8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATAD3CQ5T2N8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATAD3CQ5T2N8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms