Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC158Q5M9N0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms