Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms