Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

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Length 187 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q499Y3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q499Y3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q499Y3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q499Y3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q499Y3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q499Y3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q499Y3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q499Y3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q499Y3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q499Y3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q499Y3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q499Y3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q499Y3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q499Y3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q499Y3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q499Y3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q499Y3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q499Y3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q499Y3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q499Y3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q499Y3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q499Y3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q499Y3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q499Y3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q499Y3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q499Y3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q499Y3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q499Y3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q499Y3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q499Y3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q499Y3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q499Y3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q499Y3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q499Y3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q499Y3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q499Y3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q499Y3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q499Y3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q499Y3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q499Y3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q499Y3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q499Y3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q499Y3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q499Y3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q499Y3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q499Y3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q499Y3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q499Y3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q499Y3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q499Y3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q499Y3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q499Y3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q499Y3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q499Y3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q499Y3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q499Y3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q499Y3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q499Y3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q499Y3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q499Y3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q499Y3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q499Y3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q499Y3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q499Y3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q499Y3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q499Y3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q499Y3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q499Y3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q499Y3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q499Y3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q499Y3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q499Y3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q499Y3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q499Y3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q499Y3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q499Y3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q499Y3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q499Y3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q499Y3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q499Y3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q499Y3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q499Y3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q499Y3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q499Y3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q499Y3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q499Y3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q499Y3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q499Y3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q499Y3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q499Y3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q499Y3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q499Y3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q499Y3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q499Y3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q499Y3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q499Y3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q499Y3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q499Y3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q499Y3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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