Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LINC00303Q3SY05 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms