Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCGF3Q3KNV8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms