Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HFEQ30201 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HFEQ30201 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HFEQ30201 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HFEQ30201 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HFEQ30201 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HFEQ30201 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HFEQ30201 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HFEQ30201 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HFEQ30201 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HFEQ30201 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HFEQ30201 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HFEQ30201 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HFEQ30201 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HFEQ30201 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HFEQ30201 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HFEQ30201 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HFEQ30201 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HFEQ30201 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HFEQ30201 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HFEQ30201 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HFEQ30201 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HFEQ30201 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HFEQ30201 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HFEQ30201 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HFEQ30201 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HFEQ30201 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HFEQ30201 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HFEQ30201 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HFEQ30201 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HFEQ30201 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HFEQ30201 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HFEQ30201 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HFEQ30201 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HFEQ30201 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HFEQ30201 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HFEQ30201 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HFEQ30201 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HFEQ30201 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HFEQ30201 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HFEQ30201 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HFEQ30201 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HFEQ30201 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HFEQ30201 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HFEQ30201 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HFEQ30201 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HFEQ30201 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HFEQ30201 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HFEQ30201 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HFEQ30201 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HFEQ30201 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HFEQ30201 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HFEQ30201 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HFEQ30201 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HFEQ30201 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HFEQ30201 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HFEQ30201 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HFEQ30201 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HFEQ30201 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HFEQ30201 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HFEQ30201 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HFEQ30201 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HFEQ30201 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HFEQ30201 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HFEQ30201 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HFEQ30201 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HFEQ30201 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HFEQ30201 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HFEQ30201 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HFEQ30201 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HFEQ30201 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HFEQ30201 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HFEQ30201 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HFEQ30201 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HFEQ30201 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HFEQ30201 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HFEQ30201 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HFEQ30201 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HFEQ30201 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HFEQ30201 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HFEQ30201 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HFEQ30201 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HFEQ30201 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HFEQ30201 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HFEQ30201 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HFEQ30201 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HFEQ30201 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HFEQ30201 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HFEQ30201 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HFEQ30201 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HFEQ30201 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HFEQ30201 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HFEQ30201 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HFEQ30201 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HFEQ30201 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HFEQ30201 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HFEQ30201 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HFEQ30201 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HFEQ30201 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HFEQ30201 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms