Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC57Q2TAC2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC57Q2TAC2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms