Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms