Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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RTL8BQ17RB0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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