Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTC4SQ16873 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTC4SQ16873 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTC4SQ16873 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTC4SQ16873 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTC4SQ16873 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTC4SQ16873 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTC4SQ16873 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTC4SQ16873 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTC4SQ16873 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTC4SQ16873 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTC4SQ16873 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LTC4SQ16873 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTC4SQ16873 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTC4SQ16873 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTC4SQ16873 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTC4SQ16873 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTC4SQ16873 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTC4SQ16873 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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LTC4SQ16873 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTC4SQ16873 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTC4SQ16873 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTC4SQ16873 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTC4SQ16873 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTC4SQ16873 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTC4SQ16873 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTC4SQ16873 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTC4SQ16873 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTC4SQ16873 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTC4SQ16873 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTC4SQ16873 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTC4SQ16873 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTC4SQ16873 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTC4SQ16873 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTC4SQ16873 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTC4SQ16873 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTC4SQ16873 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTC4SQ16873 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTC4SQ16873 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTC4SQ16873 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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LTC4SQ16873 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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LTC4SQ16873 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTC4SQ16873 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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