Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms