Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PPP1R3AQ16821 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms