Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ECM1Q16610 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ECM1Q16610 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ECM1Q16610 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ECM1Q16610 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ECM1Q16610 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ECM1Q16610 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ECM1Q16610 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ECM1Q16610 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ECM1Q16610 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ECM1Q16610 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ECM1Q16610 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ECM1Q16610 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ECM1Q16610 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ECM1Q16610 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ECM1Q16610 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ECM1Q16610 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ECM1Q16610 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ECM1Q16610 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ECM1Q16610 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ECM1Q16610 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ECM1Q16610 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ECM1Q16610 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ECM1Q16610 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ECM1Q16610 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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ECM1Q16610 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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ECM1Q16610 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECM1Q16610 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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