Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP7Q16576 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms