Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK5Q16478 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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