Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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