Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NTRK3Q16288 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NTRK3Q16288 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
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