Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB3GAP1Q15042 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB3GAP1Q15042 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms